記者從國家發改委價格司獲悉，中線工程運行初期供水價格實行成本水價，并按規定計征營業稅及其附加。其中河南、河北兩省暫實行運行還貸水價，以后分步到位。全線將分6個區段定價，其中北京綜合水價最高，為2.33元（見圖）。
日前國家發改委對外發布《關于南水北調中線一期主體工程運行初期供水價格政策的通知》規定，中線工程實行兩部制水價，基本水價按合理償還貸款本息、適當補償工程基本運行維護費用的原則制定，計量水價按補償基本水價以外的其他成本費用及計入規定稅金的原則制定。基本水費按基本水價乘以規劃分配的分水口門凈水量計算，計量水費按計量水價乘以實際口門用水量計算。水源工程和干線工程各口門基本水價、計量水價可在國家發改委網站上查詢。
